Au XIIème siècle se construit le château de Pontgibaud. L’église Saint-Benoît n’est alors que la chapelle seigneuriale.
Mais au XVème siècle 2 tremblements de terre, en 1477 puis en 1490, vont mettre à mal puis faire s’écrouler la voûte.
On raconte que le Maréchal Gilbert III de la Fayette, alors seigneur de Pontgibaud, la fait restaurer et que c’est ainsi qu’on peut voir les armoiries du Maréchal à la 3ème clef de voûte de la nef et que son épouse, Jeanne de Joyeuse y fut inhumée.
En fait, le Maréchal de la Fayette était décédé depuis 1464. C’est donc ses descendants qui eurent à charge de restaurer la chapelle.
Jusqu’en 1789, l’église de Pontgibaud n’est qu’une annexe de St Pierre le Chastel, possession de l’abbaye des bénédictins de Mozac. Le patron est saint Bonnet